В статье рассматриваются риски реализации инновационных проектов предприятий российского промышленного комплекса. Целью исследования является обоснование тезиса, согласно которому разработка и внедрение инноваций выступает одновременно фактором повышения уровня рисков и инструментом их нейтрализации. Определяются источники возникновения, содержание и существенные характеристики рисков промышленных предприятий. Представлена классификация рисков промышленных предприятий, реализующих инновационные проекты, и выделяются стратегические риски, или риски недостижения целевых ориентиров экономического и инновационного развития. С использованием модели множественной регрессии анализируется влияние расходов на НИОКР на динамику основных показателей хозяйственной деятельности предприятий промышленного комплекса и обеспечение их конкурентоспособности. Представлены вариативные сценарии динамики показателей хозяйственной деятельности АО «Балтийский завод» и ООО «Завод «Челябторгтехника», которые подтверждают ведущую роль расходов на НИОКР в обеспечении поступательной динамики объемов производства и объемов экспорта, вне зависимости от типа предприятий. Обосновывается возможность нейтрализации рискообразующих факторов на основании внедрения проектного подхода к управлению рисками. Акцентируется внимание на необходимости интеграции инструментов управления инновационными проектами и инструментов управления рисками с учетом особенностей жизненного цикла проекта, что позволяет рассматривать расходы на НИОКР как инструмент предупреждения рисков снижения конкурентоспособности промышленного предприятия.